Berikut ini disajikan berbagai program kerja strategis untuk masing-masing perspektif peta strategi yang perlu dilakukan oleh FK UIN Syarif Hidayatullah untuk periode tahun 2022-2026:

1. Peran alumni
2. Prestasi akademik dan non akademik
3. Mahasiswa lulus tepat waktu
4. Program Studi terakreditasi Internasional
5. Kompetensi Sumber Daya Manusia
6. Fakultas hijau, modern dan religius
7. Publikasi ilmiah nasional/internasional
8. Pengembangan laboratorium unggulan
9. Tata kelola organisasi dan modernisasi sarana dan prasarana
10. Kolaborasi dan kerjasama antar instansi
11. Integrasi ilmu kedokteran dan ke-Islaman
12. Pengembangan lembaga melalui program studi S2/S3/spesialis
13. Pengembangan IT terintegrasi