Berikut ini disajikan berbagai program kerja strategis untuk masing-masing perspektif peta strategi yang perlu dilakukan oleh FK UIN Syarif Hidayatullah untuk periode tahun 2022-2026:

1. Tingkat kepuasan pengguna lulusan
2. Nilai rata-rata hasil uji kompetensi nasional
3. Persentase kelulusan first taker uji kompetensi nasional
4. Jumlah prodi terakreditasi internasional
5. Jumlah publikasi dalam 7 keunggulan integrasi ilmu kedokteran dan keislaman
6. Jumlah kegiatan ilmiah nasional/internasional dengan tema integrasi
7. Jumlah publikasi kolaborasi internasional
8. Jumlah stase kepaniteraan klinik di RS Haji
9. Jumlah RS jejaring dengan kegiatan penelitian bersama
10. Jumlah program studi S2/S3/spesialis
11. Jumlah Pusat Unggulan yang sudah berjalan
12. % temuan audit/evaluasi mutu yang ditindaklanjuti
13. Tingkat kepuasan dosen