Fakultas Kedokteran UIN Syarif Hidayatullah Jakarta, menerima mahasiswa Program Beasiswa Santri Berprestasi (PBSB) Kementrian Agama RI dan Beasiswa Pemerintah Daerah Kota Palangkaraya, dengan salah satu persyaratan yang diutamakan adalah lulusan pesantren dan Madrasah Aliyah serta Tahfiz Al Qur’an. Guna penyetaraan bidang akademik, FK UIN Syarif Hidayatullah Jakarta menyelenggarakan Matrikulasi (14-23 Agustus 2019) sebagai salah satu bentuk penyetaraan pendidikan yang disyaratkan sebelum menerima materi-materi kedokteran. Materi matrikulasi yang diberikan meliputi: Pendalaman Materi menjembatani pelajaran yang diperoleh di tingkat Sekolah Menengah Atas menuju ke materi program studi kedokteran. Pengenalan Sistem Pembelajaran model Student centered, Pengembangan kepribadian dalam upaya menagement stress, sharing ilmu dan saling support. Pengajar matrikulasi merupakan dosen-dosen FK UIN Syarif Hidayatullah dan memiliki keahlian sesuai bidangnya.